表5 与核苷酸序列干系的特色关键词表
关键词
说 明
allele
干系的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式，该形式差异于这一位置的现有的序列(和或许其它序列)
attenuator
存在调节转录的终止的DNA区域，它掌握了一些细菌操纵子的表达；位于启动子和第一个构造基因之间，引起转录的部分终止的序列区段
C_region
免疫球蛋白轻和重链的恒定区，和T-细胞受体α，β，和γ链；根据特定的链可包括一个或多个外显子
CAAT_signal
CAAT盒；位于可能参与RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bp上游的守旧序列的一部分；共有序列=GG(C或T)CAATCT
CDS
编码序列；对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子)；特色包括氨基酸观点上的翻译
conflict
在这一位点或区域，单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop
置换环；线粒体DNA内的一个区域，个中RNA的短的序列与DNA的一条链配对，代替了这一区域的原始配对DNA链；也用于解释在RecA蛋白质催化的反应中，侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域
D-segment
免疫球蛋白重链的多变区，和T-细胞受体的β链
enhancer
顺式-浸染序列，它增强了(一些)真核生物启动子的浸染，并能在任一方向和与启动子干系的任何位置处(上游或下贱)起浸染
exon
编码剪接mRNA部分的基因组区域；可以含有5'UTR，所有CDS，和3'UTR
GC_signal
GC盒；位于真核生物转录单位起始点上游的守旧的富含GC区域，可以以多重拷贝或任一方向存在；共有序列=GGGCGG
gene
鉴定为基因的生物学意义的区域，并已经指定名称
iDNA
间插DNA；通过几种重组中的任何一种能被肃清的DNA
intron
被转录的DNA区段，但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其撤除
J_segment
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段，和T-细胞受体α，β和γ链
LTR
长的末端重复，在确定序列的两端直接重复的序列，类型范例地见于逆转录病毒中
mat_peptide
成熟的肽或蛋白质的编码序列；翻译后润色之后成熟的或终极的肽或蛋白质产物的编码序列；位置不包括终止密码子(与相应的CDS不同)
misc_binding
不能用任何其它Binding关键词(primer_bind或protein_bind)表述的与另一个组成身分共价或非-共价结合的核酸中的位点
misc_difference
特色序列与记载中存在的有所不同，并且不能用任何其它不同关键词(conflict，unsure，old_sequence，mutation，variation，allele或modified_base)表述
misc_feature
不能用任何其它的特色关键词表述的具有生物学意义的区域；新的或少见的特色
misc_recomb
任何一样平常性的，位点特异性的或复制的重组事宜的位点，该位点中有不能用其它重组关键词(iDNA和virion)或来源关键词的润色词(/insertion_seq，/transposon，/proviral)表述的双螺旋DNA的断裂和愈合
misc_RNA
不能用其他RNA关键词(prim_transcript，precursor_RNA，mRNA，5'clip，3'clip，5'UTR，3'UTR，exon，CDS，sig_peptide，transit_peptide，mat_peptide，intron，polyA_site，rRNA，tRNA，scRNA和snRNA)限定的任何转录本或RNA产物
misc_signal
含有掌握或改变基因功能或表达之旗子暗记的任何区域，所述旗子暗记不能用其他Signal关键词(promoter，CAAT_signal，TATA_signal，-35_signal，-10_signal，GC_signal，RBS，polyA_signal，enhancer，attenuator，terminator，和rep_origin)表述
misc_structure
不能用其他Structure关键词(stem_loop和D-loop)表述的任何二级或三级构造或构象
modified_base
被指示的核苷酸是经润色的核苷酸，并应由被指示的分子(在mod_base润色词意义中给出)所取代
mRNA
信使RNA；包括5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)和3'非翻译区(3'UTR)
mutation
在此位置处，干系品系的序列中具有突发的，可遗传的变革
N_region
在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸
old_sequence
在此位置处，所表述的序列修正了此序列以前的版本
polyA_signal
聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解RNA转录本所必需的识别区域；共有序列=AATAAA
polyA_site
RNA转录本上的位点，通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基
precursor_RNA
仍不是成熟的RNA产物的任何RNA种类；可包括5'剪切区(5'clip)，5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)，间插序列(内含子)，3'非翻译区(3'UTR)，和3'剪切区(3'clip)
prim_transcript
低级(最初的，未加工的)转录本；包括5'剪切区(5'clip)，5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)，间插序列(内含子)，3'非翻译区(3'UTR)和3'剪切区(3'clip)
primer_bind
起始复制，转录或逆转录的非－共价的引物结合位点；包括合成的例如PCR引物元件的位点
promoter
参与RNA聚合酶的结合以启动转录的DNA分子区域
protein_bind
核酸上非－共价的蛋白质结合位点
RBS
核糖体结合位点
repeat_region
含有重复单位的基因组区域
repeat_unit
单个重复元件
rep_origin
复制出发点；复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
rRNA
成熟的核糖体RNA；将氨基酸装置成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份
S_region
免疫球蛋白重链的开关区；它参与重链DNA的重排，导致来自相同B－细胞的不同免疫球蛋白类的表达
satellite
短的基本重复单位的很多串联重复(相同或干系的)；大多数具有的碱基组成或其它性子与基因组的一样平常水平不同，这使得它们与大部分(主带)的基因组DNA分离开来
scRNA
小的细胞质RNA；几个小的细胞质RNA分子中的任何一个存在于真核生物的细胞质和(有时)核中
sig_peptide
旗子暗记肽编码序列；被分泌的蛋白质的N－末端构造域的编码序列；此构造域涉及新生多肽与膜的结合；前导序列
snRNA
小的核RNA；很多小的RNA种类中的任何一个都被局限于核中；几个snRNA参与剪接或其它RNA加工反应
source
鉴定序列中特定例模的生物来源；此关键词是逼迫性的；每一项至少要有一个超过全体序列的单一路源关键词；每个序列可许可有一个以上的来源关键词
stem_loop
发卡构造；由RNA或DNA单链的相邻(反向)互补序列之间的碱基一配对形成的双螺旋区域
STS
序列标记位点：表述基因组上作图界标并能通过PCR检测的短的，单拷贝DNA序列；通过测定STS系列的次序即可作出图谱的基因组区域
TATA_signal
TATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每个真核生物RNA聚合酶Ⅱ转录单位出发点前约25bp处创造的守旧的富含AT的七聚体，它可能涉及使酶定位以精确地起始；共有序列=TATA(A或T)A(A或T)
terminator
或者位于转录本的末端或者与启动子区域相邻的DNA序列，该序列可导致RNA聚合酶终止转录；也可以是阻抑蛋白的结合位点
transit_peptide
转运肽编码序列；核编码的细胞器蛋白质N-末端构造域的编码序列；此构造域参与将蛋白质翻译后运送到细胞器中
tRNA
成熟的转移RNA，小的RNA分子(75－85个碱基长)，介导核酸序列翻译成氨基酸序列
unsure
作者不能确定此区域的准确序列
V_region
免疫球蛋白轻链和重链的可变区，和T－细胞受体α，β和γ链；编码可变的氨基末端部分；可由V_segment，D_segment，N_region和J_segment组成
V_segment
免疫球蛋白轻链和重链的可变区段，和T-细胞受体α，β和γ链；编码大多数可变区(v_region)和前导肽的末了几个氨基酸
variation
含有来自相同基因的稳定突变的干系系列(例如RFLP，多态性等)，在此(和可能其它)位置处所述相同基因与被表述的不同
clip
在加工过程中被切下的前体转录本3'端大部分区域
UTR
不被翻译成蛋白质的成熟转录本的3'末端区域(终止密码子之后)
clip
在加工过程中被切下的前体转录本5'端大部分区域
UTR
不被翻译成蛋白质的成熟转录本的5'末端区域(起始密码子之前)
-10_signal
Pribnow盒；细菌转录单位出发点上游约10bp处的守旧区域，它可能参与结合RNA聚合酶；共有序列=TatAaT
-35_signal
细菌转录单位出发点上游约35bp处的守旧六聚体；共有序列=TTGACa[]或TGTTGACA[]
上述修订内容自2017年8月18日起正式履行；原标准中的被修订的内容同时破除。 特此公告。
国家知识产权局 2017年7月24日
